O pai de Madá consegue um emprego melhor em outra cidade e ela é obrigada a abandonar a vida que tanto amava — o que acha a maior injustiça do mundo. Para piorar, a recepção na escola nova não é nada boa, as colegas acham que Madá é muito infantil para o quinto ano e caçoam de tudo que a menina faz. Seu único refúgio é descontar suas frustrações em um diário, ou melhor, no seu Arquivo Confidencial Ultrassecreto!
As coisas começam a melhorar quando Madá se aproxima de Pedro, um menino que não está nem um pouco preocupado em parecer mais maduro do que realmente é. E nada mais justo do que deixar o amigo comentar e encher de desenhos o arquivo que reuniu contando os principais eventos de seu primeiro semestre na cidade nova.
Arquivo Confidencial Ultrassecreto da Madá fala das dificuldades de adaptação a grandes mudanças e narra com bom-humor os desafios da passagem da infância para a adolescência.