Quando eram apenas crianças, os irmãos Edward e Alphonse Elric foram abandonados pelo pai. Assim, forma criados apenas pela mãe que morrei poucos anos depois. Na tentativa de trazê-la de volta, realizam algo proibido: usar a alquimia para ressuscitar alguém. Assim, desrespeitaram a regra frundamental da troca equivalente, segundo a qual tudo deve estar em perfeito equilíbrio.
Além de fracassarem no experimento, pagam um preço caro por infringirem as regras: Ed perde uma perna e Al perde seu corpo. Para salvar a alma do irmão, Ed sacrifica seu braço e consgeue colocál-la dentro de uma armadura.
Os dois saem então em uma jornada em busca da poderosa pedra filosofal, a única coisa que pode quebrar a lei da troca equivalente. Será que com este extraordinário poder Edward e Alphonse poderão recuperar tudo o que perderam? Acompanhe as aventuras de Fullmetal Alchemist e descubra!