José Manoel da Conceição viveu como um cristão ao mesmo tempo identificado com o seu tempo e angustiado pelo anseio de mudanças espirituais para si e para a sociedade. No catolicismo, era o padre protestante. No protestantismo, agiu como um místico da tradição medieval e moderna: era um pastor católico. Percebido como um santo e um mártir, as portas se abriram de modo que o presbiterianismo teve nele um missionário para abertura das estradas que levaram os missionários estrangeiros ao povo e ao mesmo tempo levaram o povo a conhecer o cristianismo no modelo protestante. Não cabe à História indagar o que seria do presbiterianismo sem José Manoel da Conceição. Compete à História procurar compreender a importância que ele teve para o protestantismo brasileiro e isto é incontestável.